就在京畿一带局势风云突变的同时，远在东国的朝定也没有闲着。趁着与武田家还处于停战的阶段，他在彻底平定越中一国后便迅速返回本据河越城内，与谋士山崎秀仙、杰山云胜、斋藤道三等人计议练兵储粮各事，巩固相模、西武藏、西上野等各地城池兵砦。可以说，上杉家眼下正在日日招兵买马、朝朝积草屯粮，顿时间领内士饱马腾，人心尽附。
同时，朝定坐领东国（上野、下野、武藏、常陆、上总、下总、安房、相模大部、岩代、磐城、陆前、陆中）十二国，不断招兵买马，积草屯粮，猛士谋臣，云萃雾集。这般日兴月盛的样子，自然就招至素相仇视的敌人疑忌了。其中，以武田家方面的疑忌最大。
眼下，朝定大肆招兵买马、积草屯粮、普请各地城池等消息不消三天就已经传遍了甲信骏远三各地。先前未能成功救援越中国人一揆的武田信玄听闻这些消息便开始如坐针毡起来，他很清楚朝定此举是在针对武田家，随即召集家中重臣前来商议对策。
此时，恰好武田信繁、武田信廉、室住虎登、河洼信实、高坂昌信、岩手信盛等武田家转封至远江、骏河、伊豆等地的一门重臣已稳定领内，将领内守备任务交给麾下家臣郎党后便急忙赶往踟躇崎馆（武田氏馆）参加评定会。武田信繁、岩手信盛、河洼信实等一门亲族重臣们在见过武田信玄后纷纷称赞武田胜赖对相模侵攻的活跃，导致上杉家无法顺利夺回相模全境，迫使朝定麾下笔头家老太田资正剃发出家，也让武田领与上杉领之间增加了一块缓冲地区。
武田胜赖听闻武田信繁、河洼信实、岩手信盛等一门亲族重臣的话后并没有骄傲，而是这样回答的：“几位叔父以及重臣们的言之过甚，此番晚辈之所以能够侥幸击败太田左卫门佐、山本寺伊予守等上杉家名将皆是上得甲斐源氏列祖列宗的在天之灵，又承蒙父亲大人福泽，武田家之威名，以及麾下诸将冲锋陷阵，亲冒矢石，晚辈只不过效奔走之微劳，何足挂齿？”
“能知大体，又不居功，昔日大汉之大树将军，不过如此，日后定能成为武田家之栋梁！”武田信繁听完武田胜赖的话后不禁感叹道。
“典厩所言甚是。”武田信玄听完武田信繁的话后很满意的点了点头。
“少主勇猛善战乃武田家之福！”整个大广间里的武田家重臣们皆异口同声的说道。武田信玄听后虽然表面上很是高兴，但是内心颇为不快。
“本家与上杉家结仇已达十余年，全赖甲斐源氏列祖列宗之威灵，诸将协力，四郎一出，为本家大雪前耻，使上杉家无法占有相州全境，不可谓非武田家之福。但因藤原朝定屡次冒犯幕府、京公方，甚至弑杀古河公方、擅立关东公方、攻灭众多不从之人等在东国横行霸道、肆意妄为。据细作汇报：藤原朝定已将原先的奥州分为陆前、陆中、陆奥、磐城、岩代五国，并且大量易置在地国人豪族、招致贤豪，武州菖蒲的佐佐木信浓守（原古河公方奉公众）、武州净法寺的安保中务大辅（原山内上杉家臣）、武州入间的毛吕佐渡守（原山内上杉家臣）、相州足柄的曾我伊贺守（原幕府奉公众）等人先后率一族郎党出仕藤原朝定，又新得平山越前守、平山三河守、平山下野守、金子大藏少辅、冈部备中守等相州有力武将，再加上东国原有水陆两军，至少带甲十万以上！其当初继任扇谷上杉家家督之时，带甲不过一万，麾下家臣仅有太田资正、难波田宪次两人值得其信赖，尚能数败当时如日中天的北条家。此时上杉家羽翼丰满，不经北陆道西向争夺京畿，必然会西向争夺本家在甲信东海之地。眼下，藤原朝定已令麾下家臣诸将巩固在相州、西武州、西上州等各地邻近我武田领的城池兵砦，并且在不断招兵买马，积草屯粮，并且意图将本据迁移至江户城，蓄意窥伺，不问可知。若待其盛兵西进，为时已晚，不如趁其未定，先事进军。诸位以为如何？”武田信玄稍微平静一下后对着大广间内所有重臣说道。
“馆主大人所言极是，但以臣观之，藤原朝定先前曾丢失旧领本据，在外颠沛流离多年，若非得到越后诸将的协助，如何得以坐领东国十二国之地？一两年之内，臣敢保其绝不敢对本家发起侵攻：一、其新夺陆前、陆中等国根基不稳，内有国人豪族蠢蠢欲动，外有南部家对其虎视眈眈，大大小小战事不断。二、家中宿将重臣中的太田左卫门佐、难波田侍从等人先后被转封至远国离开故土武州；而且立下赫赫战功的毛利丹后守也以‘擅动刀兵’为由被软禁在会津若松城外的长命寺内，剥夺其旗头一职；就连麾下平、丹、木内、松户等旗本众也因‘不听号令’为由改易至陆中，上上下下皆有怨言，而藤原朝定欲整顿兵马向本家侵攻，若得不到宿将重臣的支持将难以进行。三、藤原朝定所领的东国十二国，悉易新人，风土民情，均非素悉，劳来安辑，动轧经年，出兵西进，良不易与。我不攻彼，彼决不能自启战端，以耗未充之兵力。葛山备中守以及其一族久居河东，坐领骏东，武田刑部少辅、横田十郎兵卫尉等家中重臣分别镇守骏州重镇兴国寺城、深泽城等地，威名之盛，足资震慑，但利守而不利战。主公欲趁少主战胜之威，以殄方张之敌，既不能倾国以争关东八国，又惧越后上杉弹正尹之进蹑其后，不如本家就此养精蓄锐，静观时变。上杉弹正尹素有率军上洛匡扶朝廷幕府之心，不如待其举兵上洛后本家再出兵袭取北陆道诸国，不论上杉弹正尹的上洛之战是否胜败，本家皆能获利不少，不知馆主大人尊意如何？”这时，山本勘助向武田信玄进言道。
“眼下冈部丹波守、朝比奈骏河守、朝比奈备中守等今川家旧臣们正坐镇相州，招降纳叛、深沟高垒，其志在夺取骏远三三州之地。小田家先前不是主动效忠京公方和堀越公方吗？正好让其在领内举兵，只要藤原朝定调集军势侵攻小田领，那么就是本家将肘腋之患消除的时候。”山本勘助话音刚落，武田信繁倒是向武田信玄出了一个主意。
“我正为此事日夜忧心，今得勘助、典厩之言如释重负。典厩火速返回骏州统辖骏州诸将准备随时攻入相州，勘助立即派遣得力之人进入小田领内让小田讃岐守尽快举兵。”武田信玄听完武田信繁的话后很满意的点了点头后说道。
“馆主英明！”大广间内的其余重臣们随后异口同声的称赞武田信玄。
随后，评定会一结束武田信玄便令远江、骏河、伊豆各地的重臣们暗中征召军势做好乘虚攻入相模的准备。武田信玄很清楚调集大军东进肯定无法避开朝定的耳目，故而再令南信浓的松尾城城主小笠原信岭、吉冈城城主下条信氏、福岛城城主木曾义昌、阿岛城城主知久赖元等将率五千余军势号称一万大军大张旗鼓的出兵三河国，前去讨伐亲织田家的东广濑城城主三宅高贞、西广濑城城主三宅高清、高桥信正（西条吉良家家臣）、高桥政信（西条吉良家家臣，高桥信正之子）。
永禄三年，九月二十五日。原先已经做好出兵上洛的织田信长在听闻武田信玄派遣木曾义昌为总大将率小笠原信岭、下条信氏、知久赖元等南信浓诸将的五千余军势前去攻打亲织田家的三河国豪族三宅高贞、三宅高清、高桥信正、高桥政信等人之时，立即调转兵锋率两万余大军进入水野领，生怕武田军是醉翁之意不在酒。
历时近三个月的相模攻略和平定东越中国人一揆的战事才结束不久，朝定还来不及享受一下久违的安宁，常陆方面就传来了令他愤怒不已的战报。
据太田资正所传来的战报上说，小田家当主小田氏治奉堀越公方足利藤政之命，意图恢复古河公方家旧领，悍然联合多贺谷氏、水谷氏等原古河公方奉公众旧臣举兵谋逆，现已大举侵攻真壁领、盐屋领、高玉领、笠间领、石桥领等地，并且在常陆各地刈田狼藉（在敌方领地内的村子的农作物如稻谷、麦子等收获前，率军将其收割）、乱暴狼藉（侵犯掠夺）人口、牛、马等达到了上千之多。以致境目（在有着两个及以上的势力相互对战时，成为战场的地方）骚然，各郡乡莫之能御，纷纷笼城待援。
真是内忧方平，外患又起，这上杉家真的是永无宁日了。
接到战报后，朝定立即下令诸川城城主五味高重、逆井城城主新发田长敦征召五千军势后进驻下总太田城，以防小田家趁势对下总展开侵攻。
十月一日，五味高重和新发田长敦二人才率五千军势进驻下总太田城后不久，小田军先阵多贺谷重康（多贺谷重经之弟）、多贺谷经长（多贺谷重康叔父）、多贺谷经伯（多贺谷重康叔父）、多贺谷安艺守（多贺谷氏一门亲族）等将率五百余人在夺取多贺谷家旧领下妻城后果然意图进犯下总国，在兵临太田城下之后得知城内上杉军达五千之众后便只好悻悻而去。
朝定大为震怒，随即下令下总、上总、安房诸将迅速在各自领内征召军势准备讨伐反叛的小田氏治。同时，朝定还派遣臼井城城主斋藤道三率军五千进驻常陆河内郡，联合龙之崎城城主笠间胜弥、江户崎城城主高玉茂兵卫、牛久城城主石桥新藏、岛崎城城主游佐续光、小高城城主西野宗庆等将加强南常陆的防御。
虽然朝定陆陆续续派出了三名重臣率军驻防在下总国的门户之地，但是他随后仔细想了想后便发觉事情有些蹊跷。小田领四面皆被上杉家家臣的领地所包围，若非受外部有力大名挑拨调略，怎么可能会在毫无胜算的情况下举兵反叛？
很快，加藤段藏麾下的忍者在上总胜浦截获了武田家与小田家通信的信使，其携带的密信也被送至朝定的手中。
在获得密信后，朝定打消了调动下野、上总、下总、安房、武藏、磐城等地的军势集中优势兵力迅速攻灭小田家的念头。同时，朝定令加藤段藏加大力度对东海道、甲信一带的谍报工作。
不出两天，加藤段藏就将武田家正暗中征召骏河、远江、伊豆等地军势意图夺取相模一国的消息告知朝定。朝定当即下令相模国内的善宗次、长野业盛、池田盛周、冈部元信、朝比奈泰朝、朝比奈信置、平山光义、冈部忠秀、金子家长等相模诸将迅速征召军势做好笼城固守的准备，对武田家方面严加防范。同时，为了不让关东公方今川氏真有所闪失，朝定只好让今川氏真离开镰仓鹤冈八幡宫前去古河城外鹰狩。
十月五日，武田信玄任命武田信繁为总大将率远江、骏河、伊豆等诸国军势大举进犯相模，兵锋直指西相模重镇足柄城。足柄城城主冈部元信决定先在金时山打一个伏击战，正好杀杀武田军的威风。
冈部元信令从兄弟冈部长纲在冈部家、朝比奈家的军势中精挑细选了一千余军势，让他率军在武田军的必经之路上设伏。冈部元信在冈部长纲出发前再三告诫他：“敌军进入设伏之地后不要攻击其先阵军势，因为其本队紧随其后，你肯定抵挡不住。故而，让武田军先阵军势离开设伏之地后，等到打着孙子‘四如军旗’的军势抵达后，那才是武田军的本队。你到时候可以出其不意的发起攻击，必然能大获全胜。”
随后，冈部长纲按照冈部元信的命令，果然把武田军打了个措手不及。武田军本队被冈部军打得晕头转向，武田信繁认为相模国内的上杉军早已对武田军有所防备，为了避免孤军深入被全部歼灭，他立即下令全军退往骏河河东郡。冈部长纲很清楚敌众我寡的态势，故而见好就收，对准备撤往骏河河东郡的武田军不做追击，将讨死三百余武田军的首级在金时山下筑成京观后便返回了足柄城。
武田信繁进入深泽城后才得知袭击自己本队的上杉军仅有一千余人后愤怒不已，随即对左右诸将说道：“上杉家在相州的有力武将仅有冈部丹波守、朝比奈骏河守、朝比奈备中守三人而已，当以计去之！”
两天后，武田信繁联合小田原伊势家共集结了两万两千余大军，浩浩荡荡的开入了足柄上郡境内。令所有人感到诧异的是，此次武田军竟然会一反常态，一路上军纪非常严明，对上杉领的领民秋毫无犯。抵达足柄城下后，武田信繁并不下令攻城，而是亲自带着数名骑马武士跑到大手门附近，对着城头上的城兵大喊道：“冈部丹波守殿既然以密信召我前来，为何不出来迎接犒劳我武田家大军？”
足柄城内的守军听完武田信繁的话后完全不知道武田信繁这葫芦里卖的到底是什么药，随即向坐镇本丸的冈部元信汇报。
而冈部元信听完麾下城兵的汇报后仅仅只是冷笑了两声，他很清楚这是武田信繁所玩的反间计，不过武田信繁玩得可以用拙劣来形容。随后，冈部元信下令足柄城内的守军坚守不出，他倒是想看看武田信繁还有什么花样能玩出来。
之后，武田信繁率军将足柄城包围了一天一夜后，见足柄城内戒备森严严阵以待，显然对他这个略微显得有些小儿科的计策无动于衷，武田信繁对此很是失望，但是又不敢立即对足柄城发动攻击，只好下令全军撤离足柄上郡，折往大住郡、陶绫郡一带继续刈田狼藉。
正所谓来而不往非礼也，武田信繁给冈部元信来了一次亲密问候，冈部元信当然也要对武田信繁有所表示才行。
十月九日，正当武田信繁率两万两千余大军进入大住郡时，冈部元信再次派遣冈部长纲率军一千余奔袭相模伊豆边境，目标是北伊豆重镇山中城。
另一方面，山中城内的守军在冈部长纲部一千余军势翻越箱根卡后才得知有一支上杉偏师意图袭击山中城。随后，山中城城主米仓重继（米仓宗继）安排留守城池的一门亲族众米仓信继、米仓丰继、米仓定继等人随即率城兵五百余出城迎战，与冈部长纲部展开遭遇战。然而，米仓信继、米仓丰继、米仓定继等人由于无法掌握确切情报和寡不敌众等原因，被冈部长纲打得大败而逃，武田军被讨死达三百余人。
冈部长纲随即乘胜追击，一鼓作气将北伊豆重镇山中城攻落，将城内囤积的粮草辎重全部付之一炬，然而再全身而退，凯旋返回足柄城中。
武田信繁此刻万万没有想到，自己眼下正在大住郡、陶绫郡等地刈田狼藉得热火朝天，冈部元信却趁自己不备在背后狠狠地捅了自己一刀，还把伊豆国内调集用于攻略相模国的大部分粮草辎重烧了个精光。
武田信繁深知后方战败，军心必然浮动，只好停止在大住郡、陶绫郡等地的刈田狼藉，率军进入小田原伊势领的足柄下郡进行休整。
永禄三年，十月十日。就在武田信繁率两万两千余武田军入侵相模国的同时，朝定很快便得知了此事，他随即下令位于房总两国的家臣东金城城主狩野秀治、峰上城城主正木道俊、椎津城城主板屋光胤、冈本城城主冈本安泰等将迅速征召五千余军势后先行出阵相模，前去联合长野业盛、池田盛周、善宗次等东相模诸将在相模川附近布置防线，不让武田军进一步深入相模腹地。
与此同时，织田信长为了能够消除后顾之忧和两线作战，随即迅速与正在派兵攻打西三河亲织田家豪族的武田信玄达成了和议。两家按照协议中的势力范围划分各自的归属界限，其中占据碧海郡大部分的水野家归属在织田家旗下，占据额田郡的德川家重新返回织田家旗下成为从属大名，而加茂郡、设乐郡、八名郡、宝饭郡、幡豆郡、渥美郡则归武田家所有。这也宣告着长达数年之久，遍布着三河远江两国的战事终于能够暂时告一段落了。
就在小笠原信岭、下条信氏、木曾义昌、知久赖元等南信浓诸将所率的五千余武田军返回南信浓后不久，织田信长派遣不破光治、内藤胜弥等家臣率两千余军势从北近江小谷城外的休怀寺前去迎接足利义昭。
与之相对的，浅井长政也派遣重臣上坂城城主上坂意信（上坂氏原为近江守护京极氏执权，上坂意信继任上坂氏家督后成为了浅井家家臣）、山本山城城主阿闭贞征等人率一千五百余军势护送他们到美浓关原。对于这位四处流浪多时的“将军家的当主”而言，这一次的旅行给了他绝对的安全感，因此足利义昭心中感到非常高兴。
随后，足利义昭便入住暂时的居馆——美浓西部的立政寺内。就当足利义昭在立政寺内过上一段安生日子后，织田信长于十月二十日来到立政寺内参见足利义昭，同时向足利义昭进献一大堆礼物：国纲太刀一柄、苇毛马一匹、大铠两套、沉香百斤、缩布百匹、锻子三十匹、虎皮两张······
足利义昭在见到织田信长所赠的这么多礼物后不断的点头，甚至快要激动的留下泪来。自从足利义昭以‘将军家的当主’自居后，从来没有哪一家大名送给自己那么多的礼物，就连幕府重臣、占据大部分东国的上杉家都没有理睬过自己，送去的书信也大都石沉大海毫无回应。他觉得织田信长一定能够圆他的将军梦。
十一月一日，织田信长在美浓、尾张、西三河、伊势、志摩等国大规模征召下，兵力达到了四万余。在正式出兵上洛之前，织田信长率马廻众五百余人从本据岐阜城出发，前往佐和山城和六角义贤、六角义治父子二人展开交涉，希望六角家能够参与拥立、护卫足利义昭加入上洛之战，并且献上人质交换誓书等等。但是，早就跟三好三人众有过协议的六角义贤、六角义治父子二人在交涉中始终坚持拒绝拥立足利义昭参加上洛之战。
在多次与六角家交涉无果后，织田信长随即与浅井长政商议准备向六角家宣战并且做好攻打六角家支城之一的箕作城和对抗三好三人众之事。同时，三好长逸、三好政康和岩成友通三人随后在十一月五日前往南近江石部城与六角义贤、六角义治父子二人进行会面，双方再次对阻止织田信长率军上洛等事情进行磋商。
而此时的六角家才经历了野良田惨败和观音寺骚动正处于低潮期，六角家中乱象丛生，上下离心离德，甚至连十年以前的五分之一都不如了，若是比起二十年前六角家的鼎盛时期，更是天差地别不足以道计，眼下完全不是织田军的对手。若不是有三好三人众在其后暗中援助，六角义贤、六角义治父子二人哪里有胆量同时与织田家和浅井家开战？
为了尽可能的拖住织田家大军西进上洛的时间，六角家大规模对本据观音寺城周围的八幡山城、长光寺城、箕作城、和田山城、佐生城、荒神山城、目贺田城、高取城、敏满寺城、山崎城、田山城、日野城等十八座城池兵砦进行普请增筑，意图用笼城战让织田军分兵攻打，能够争取更多的时间来与三好家的大军合流后击退织田军。
在确定谈判破裂后，织田信长于十一月八日与浅井长政在南近江佐和山城外会师，织田军随后在高宫一带进行两天休整后便进军至爱知川附近布下本阵。联军总数瞬间便膨胀至五万余人，联军士气大振，营砦绵延如同长蛇一般，篝火遍地燃起如同星空一样。
六角义贤、六角义治父子二人得知织田军大军已经进入南近江后，为了抵御织田军的来袭，随即做出了分兵在箕作城、和田山城等要地重镇加强防卫的决定。以吉田重高（佐佐木氏支流，吉田重政之子）、吉田重光、吉田新介、吉田安艺守（太尾山城城主）、建部秀明、建部寿德、建部日向守（六角义治侧近）等人率军三千余进入箕作城协助城主建部贤文笼城，田中治部大辅（和田山城城主）、田中山城守等人率军六千余镇守和田山城，六角家谱代重臣、近江守护代蒲生贤秀负责固守日野音羽城。蒲生贤秀认为箕作城守军数量还是太少根本无法抵御织田·浅井联军的进攻，原本他想要出兵增援箕作城，但是六角义贤却认为完全沒有继续增援的必要，因此蒲生贤秀只好返回自己的居城日野音羽城继续做好笼城死守的准备。
而织田信长在十一月十二日先派麾下重臣森可成、柴田勝家、坂井政尚为先阵，与驻守在观音寺城外的六角军交战，讨死百余人，取得了织田军进入南近江以来的首胜。原先，织田信长希望由浅井长政负责率军监视六角家的本据观音寺城，然后由织田军去负责攻打和田山城。但是，浅井长政为了尽可能获得南近江领地和增加浅井家对南近江的影响力拒绝了织田信长。随后，织田信长只好改为家臣坂井政尚去负责率军监视和牵制观音寺城，美浓三人众（稻叶良通、安藤守就和氏家直元）负责率军监视和牵制和田山城，做好对城池佯攻的样子。
织田信长随后派遣家臣佐久间信盛、木下藤吉郎（木下秀吉）、丹羽长秀、浅井政贞（尾张浅井氏）等人攻打箕作城。木下藤吉郎部两千三百余军势部署在箕作城北面，丹羽长秀部三千余军势部署在箕作城东面，以佐久间盛次和蜂须贺正胜担任先阵攻城，德川军的松平信一也参加了先阵与织田军一同攻城。随后，箕作城城将吉田重高、建部秀明虽然意图顽强抵抗，以弓矢、洋槍铁炮攻击织田军，却还是被织田军攻破了大手门，德川家家臣松平信一率先率军攻入城内，紧随其后的便是林通氏（丹羽长秀家臣）、佐久间盛次（佐久间信盛之弟）、竹中重治、木村重茲等人一同攻入城中共同立下了一番乘之功，被编入木下藤吉郎部的前田利家也率先冲阵杀敌，讨取城将建部日向守立下了一番首之功，箕作城在当天半夜遭到攻陷，城主建部贤文、城将建部秀明、吉田重高等人率残部突围逃亡，城将建部寿德在投降织田军后被编入丹羽长秀部效力，箕作城城兵被讨死达五百余人。和田山城在得知箕作城在短时间内被织田军攻落后，城兵惊恐万分，尚未与织田军交战便开始大量逃亡了。织田军并没有像六角义贤、六角义治父子二人所预想的那样将兵力分成十八份。
观音寺城内坐镇的六角义贤、六角义治父子二人在发现织田军主力已经转移后，立即出城袭击坂井政尚部，结果却被坂井政尚所击退，坂井政尚之子坂井久藏在此战中奋战有功，随后获得了织田信长和足利义昭赐下感状嘉奖。德川家臣松平信一在箕作城陷落的第二天，因为作战勇猛而获得织田信长的褒奖，之后织田信长还赏赐桐纹革胴服给他。丹羽长秀家臣林通氏也同样因为作战勇猛，获得织田信长赐下的感状褒奖。
在箕作城陷落后不久，织田信长便将本阵设在了箕作山中，并且于翌日对六角家的本据观音寺城发起了总攻，六角义贤、六角义治父子二人自知六角军士气低落、寡不敌众，难以抵挡织田军的兵锋，随即放弃本据观音寺城逃亡，轻车熟路的走了祖先的老路，准备跑到深山老林之中与织田军展开游击战。随后，六角义贤、六角义治父子二人便逃往甲贺郡，甚至还一度逃往伊贺国躲避织田军的兵锋。但是，令六角义贤、六角义治父子二人没有想到的是，如今的局势再也不像当初六角高赖那样拖着耗着就能解决的了。那时的六角家面对的敌人是孱弱的室町幕府，而如今六角家的敌人却是新崛起的织田信长，所以直到织田家灭亡后六角家都没能恢复旧领。
在观音寺城被织田军攻落后不久，六角家重臣蒲生贤秀还在居城日野音羽城继续笼城死守抵挡织田军。但是，织田信长并不打算对日野音羽城发起攻击，随即派遣与蒲生家有姻亲关系的神户具盛（原六角家家臣，蒲生定秀女婿，神户氏总领七代目，接受织田信长之子织田信孝为婿养子）前去劝降蒲生贤秀（蒲生定秀之子）。在神户具盛的劝说下，蒲生贤秀放弃了抵抗，交出其子蒲生鹤千代（蒲生氏乡）为人质，投降织田家。就在近江守护代家蒲生家投降织田军后，南近江便很快被织田军顺利平定下来，从而减少了伤亡和节省了更多的时间。
而长光寺城、八幡山城、箕作城、和田山城、佐生城、荒神山城、目贺田城、高取城、敏满寺城、山崎城、田山城等观音寺城周边的十八座城池兵砦先后被织田军攻陷或是劝降，六角家中有力家臣进藤贤盛、后藤高治、永原重康、平井定武、青地茂纲、永田景弘、加贺美兵部少辅（井上兵部少辅、各务兵部少辅，六角氏分家）、池田景雄、宮木贤祐（观音寺城奉行众之一）、山崎片家、山冈景隆、小川祐忠等人先后投降织田家。织田信长在平定了南近江后才得知为何当初六角义贤、六角义治父子在谈判之时那么傲气了，原来有着执三好家牛耳的三好三人众作为后盾。
在听闻六角义贤、六角义治父子二人转往鲶江城笼城死守后，织田信长便让浅井长政率六千余军势进入箕作城、观音寺城驻守，以防止六角家的反扑。织田信长在迅速击败六角家后，派遣家臣不破光治为使者返回美浓立政寺内向足利义昭报捷，并且迎接足利义昭出兵参阵。
十一月二十日，织田信长与足利义昭进入琵琶湖的三井寺，而织田·浅井联军则是在大津的松本、马场等地布阵，之后以三井寺内的光净院作为足利义昭的暂时居所。随后，织田信长便率大军正式往京都进发，准备与三好家展开作战。
永禄三年，十一月二十日。在织田·浅井联军锐不可当的攻势下，内忧外患的六角家很快便土崩瓦解了。从此以后，六角家在南近江半国的霸权化为了南柯一梦。同时，尾张织田氏的威名顿时间传遍了畿内数国，占据京畿的三好三人众感到了前所未有的压力。
由俭入奢易，由奢入俭难。六角义贤、六角义治父子自从主动放弃本据观音寺城后便感到后悔了。北伊势、南近江、伊贺各地的家臣、国人领主们先后倒向织田家，就连进藤贤盛、后藤高治、永原重康、平井定武、青地茂纲、永田景弘等家中重臣都先后主动投降织田·浅井联军，使得六角义贤、六角义治父子反攻南近江的本钱越来越少，眼下他们只能在甲贺、伊贺等地的深山之中继续蛰伏着。
于此同时，足利义昭麾下的奉公众细川藤孝、明智光秀（朝定在永禄之变后暗令明智光秀在合适的时机出仕织田家，尽可能的在京畿一带扩张势力）等人，则是摇着‘将军家的当主’足利义昭这面大旗，劝说和调略京畿一带的国人领主们转变风向“弃暗投明”。不过，具体是投向足利氏的军门之下，还是投向声威正盛的织田家军门之下，却没有说得太清楚。在一路高奏凯歌的时候，绝大部分人总是会有意无意的忽略掉这些看似并不怎么重要的问题。
织田信长在快速平定南近江的同时，立即下达了一道非常严苛的命令——一钱斩令。严禁织田·浅井联军在未经许可的情况下随意进行乱捕、人狩，更加不允许奸**女，若有违背者杀无赦。
不仅如此，织田信长还下令织田军将南近江主要街道打扫的干干净净，就连无人收理的尸体也都由织田军收拾干净了。
就当织田信长节节胜利即将攻入京都之时，武田信玄也没有闲着。自从武田家与织田家重新划分了三河国归属界限后，便迅速将家臣转封至东三河各地重镇要地之中去，进一步加强对东三河各郡的控制，企图将东三河各郡经营成出兵上洛的桥头堡。
武田信玄先将河出良则（河出城城主）、高木善右卫门尉、菅沼定忠（四十骑领主，北设乐郡豪族，田峰城城主，山家三方众，又称田峰定忠、田峰定吉）、长篠正贞（三十骑领主，南设乐郡豪族，田峰菅沼氏分家，奥三河众，山家三方众，长篠城城主，又称菅沼政定、菅沼正定、菅沼正贞）、奥平贞能（一百五十骑大身领主，奥三河众，山家三方众，作手城城主，田代城城主，又称奥平定能、作手贞能、作手定能）、菅沼定盈（野田菅沼氏，奥三河众，野田城城主）等先前主动降服于武田家的东三河国豪族们编为三河先方众，由一门亲族众中的大井虎昌担任三河先方众旗头一职，并且坐镇东三河最重要的战略据点——吉田城。
随后，武田信玄还将家臣漆户虎光（原武田义信補佐役）转封至宝饭郡牛久保城领有五千石知行地、三枝虎吉（足轻大将众）转封至宝饭郡上乡城领有一万五千石知行地；胜津野昌忠（谱代家老众）转封至宝饭郡长泽山城领有八千石知行地、荻原昌明（原板垣信方与力，武田家一门众）转封至渥美郡中山城领有五千石知行地，大井虎昌（武田家一门亲族众，大井信达末子，大井信达长女为武田信玄之母）转封至渥美郡吉田城领有一万五千石知行地。
十一月二十三日，获知六角义贤、六角义治父子二人兵败如山倒、织田·浅井联军即将出兵上洛，三好三人众斗志丧尽，随即弃守无险可守的京都。参议高仓永相（高仓永家次男）经由八幡逃往大坂，时任关白近卫前久深知足利义昭进入京都后定然不会轻饶自己，随即步了高仓永相的后尘也逃往大坂，权中纳言劝修寺晴右（劝修寺晴丰之父，劝修寺家的第第十四代当主，内大臣劝修寺尹丰之子）屏居。十一月二十六日，时织田信长便带同足利义昭进入京都，在清水布阵。织田信长也在进入京都后命令菅屋长赖制定洛中法制，派军势护卫宫廷，维护京都一带的治安。但是就在织田·浅井联军上洛之后，由松平信一所率领的部分德川军军势与部分织田军发生了冲突，在经过织田信长的裁决之后，松平信一先率领德川军返回三河国。
这时，三好一方的细川昭元与三好长逸、三好政康等人率军三千余固守在芥川城；篠原长房率军两千五百余驻守在越水城、泷山城两地；岩成友通率军两千余固守在胜龙寺城；三好康长率军两千五百余固守在高屋城；足利义荣与其父足利义冬、细川真之、三好长治则率军三千余固守在富田普门寺城内。
织田信长率军进入京都之后将本阵设立在东福寺，在二十八日时派遣家臣柴田胜家、蜂屋赖隆、森可成、坂井政尚四人担任先阵率领一万余大军越过桂川攻打三好方岩成友通所镇守的胜龙寺城。面对织田军气势如虹的来袭，岩成友通并不打算困守孤城，随即派兵出城与织田军展开野战，结果却遭到织田方四将击破，麾下知名武士五十余人被讨取，柴田胜家、蜂屋赖隆、森可成、坂井政尚等人随后将斩获的首级送往东福寺，由织田信长进行首实检。经过此战之后，岩成友通自知不敌，遂在隔日开城向织田军投降。
随后，三好康长在得知岩成友通开城投降后只好放弃高屋城退离，饭盛城紧接着也开城投降织田军，在畠山高政前来参见足利义昭表示归降时，足利义昭也将原属于畠山高政的高屋城，重新赐回给他。织田军之后便在十一月三十日在摄津国的河边郡、武库郡等地放火。
织田军后在十二月一日于山崎一带布阵，先阵安置在天神山一带，在织田军的步步进逼下，细川昭元、三好长逸与三好政康趁夜放弃了芥川城，篠原长房在越水城、泷山两地的城兵也随后撤退，织田信长遂迎奉足利义昭进入芥川城。
紧接着织田·浅井联军就像被神佛附体一般一路高歌猛进开始扫荡摄津国，随后在十二月五日派遣五万大军攻打尚未降服的摄津豪族池田胜正的池田城，水野忠政家臣梶川平左卫门与织田信长的马廻众鱼住隼人争先突入城池的外构，结果梶川平左卫门被池田军讨死，鱼住隼人身受重伤被麾下足轻抬回织田军本阵，随后织田军暂停了对池田城的进攻。池田胜正造成织田军阵亡十多名知名武士、伤亡达百余人，但是织田军也攻入了池田城的三之丸内，织田信长随后在池田城的城下町中四处放火，池田胜正深知自己在失去三好三人众等有力外援下难以继续抵抗织田家，随后便主动开城交出人质向织田军投降了。就在池田胜正开城投降后，摄津国的国人领主们玩起了自己的拿手好戏——城头变幻大王旗，迅速抛弃三好家成为织田家旗下的外样家臣。
河内国的三好义继跟大和国的松永久秀当时正与三好三人众敌对，在织田信长与足利义昭上洛之后，也立即遣使谢罪希望能够归附，可足利义昭却表示不愿意接纳他们，但是在织田信长的多次劝说之下才同意两人投降。大和国豪族箸尾高春在看到三好三人众一方节节败退后也只好投降足利义昭。
在五万余织田·浅井联军的横扫下，三好家的势力宛如秋风中的落叶一般，三好家不得不带着足利义荣计划撤回东四国。三好家方面在京畿各地的溃败使得京畿一带风声鹤唳草木皆兵，和泉国、河内国断断续续的国人领主们迅速望风而降。短短一个月不到，织田信长便在京畿一带掀起了一阵惊涛骇浪。山城、河内、和泉、大和、摄津等国一路横扫而过，各地的国人领主们无不望风归降，织田军如今就像是滚雪球一样，不断的膨胀着，而且越滚越大，大到已经令他的对手感到绝望。由于有着浅井家的支持、朝仓家和若狭武田家的按兵不动，整个京畿在瞬间攻守易位，变成了一边倒的局势。
足利义昭根本没有想到事态会发展的如此顺利，原先还以为京畿各地的国人领主们和三好家会拼死抵抗，即使很自信乐观的预计也要耗时近半年才能攻略京畿诸国，尤其是三好家这个最难啃的骨头。
就当织田信长滞留在芥川城之时，各方使者也陆续送上珍物，像今井宗久献上名物松嶋茶壶跟绍鸥茄子，其中还有源义经在一之谷穿过的甲胄。摄津国的高槻城主入江春景、茨木城主茨木重朝也相继投降，伊丹城主伊丹亲兴在足利义昭仍滞留越前国时，就与足利义昭有所往来，因此在织田信长跟足利义昭进军摄津时便立即表态归降。而三好三人众所拥立的征夷大将军足利义荣在撤退途中患病身亡后，篠原长房便奉三好长治与细川真之渡海退往阿波国。
在织田信长跟足利义昭战胜三好三人众之后，足利义昭在芥川城阵中对近畿的领地进行重新分配。原先足利义昭希望由织田信长来统领畿内五国，但是织田信长只愿意领受和泉国的堺町与近江国的大津、草津。因此，由畠山高政领有高屋城、三好义继领有若江城各掌河内国各半，大和国跟和泉国的志贵城则依然交由松永久秀，摄津国则一分为三，由和田惟政担任芥川城主跟伊丹城主伊丹亲兴、池田城主池田胜正并为摄津三守护，伊丹亲兴的三万石领地、池田胜正的两万石领地都获得了安堵文书，细川藤孝则领有胜龙寺城。
足利义昭在十二月二十日正式获得了朝廷的将军宣下，晋任为征夷大将军。得知此事的织田信长立即送上诸多厚礼，同时在细川官邸内為足利义昭举办就任典礼。感激不已的足利义昭随即回赐给织田信长太刀、酒杯等物品。
同时，织田信长为了减轻松永久秀的压力，好让他顺利平定大和一国，便派遣重臣佐久间信盛等人率军一万八千余出兵协助松永久秀。足利义昭看在织田信长的面子上也派遣了幕臣细川藤孝、和田惟政等人率领五千余军势支援松永久秀重新攻入东大和。随后，织田·足利联军以电光火石之势迅速攻陷了筒井城、丰田城、平城等地，就连郡山城也投降松永久秀，大和一国几乎成了松永久秀的天下。而兵败如山倒的筒井顺庆就只好前去投奔深山里的豪族秋山直国。
就在足利义昭顺利继任征夷大将军之后，担任关白一职的近卫前久，被视为是“逆贼”的同党，再加上前任关白二条晴良对其落井下石，结果义昭奏请朝廷，将前久罢免和逐出京都，随后由亲织田家·足利义昭的二条晴良继任了关白一职，朝廷中大部分的公卿朝臣都纷纷表示让足利义荣能够顺利得到将军宣下的都是近卫前久的阴谋，朝廷和皇室是受到蒙蔽后才做出了错误的判断，上下百官也都是被胁迫的，并不是出自本意。
近卫前久被解除关白一职后，在丹波国豪族赤井直正的帮助下，从京都前往黑井城的下馆居住，此后在第十一世本愿寺显如的帮助下移居摄津国的石山本愿寺。此时认显如的长子教如为自己的养子。
永禄三年，十二月三十日。就当武田信繁在相模国的侵攻中多次被冈部元信、长野业盛、池田盛周等相模诸将击退挫败后，丝毫不能在相模一国讨得便宜，随后他只能率军无功而返。看来，武田家并没有传说中的那么强大，朝定和冈部元信等人不约而同的得出了结论。
永禄四年，正月五日。就在朝定太太平平的与家人过完新年后，冈部元信、朝比奈泰朝、朝比奈信置、长野业盛、池田盛周等相模诸将纷纷上书请求朝定，要求主动攻击武田家和小田原伊势家，收复被武田家所占据的伊豆、小田原伊势家所占据的相模国陶绫郡和足柄上郡等地。同时要求朝定能够派遣一支偏师攻入甲斐或者北信浓牵制武田信玄的本军。
朝定在看完冈部元信、朝比奈泰朝、朝比奈信置、长野业盛、池田盛周等相模诸将的上书后当即同意，令上杉景满统辖本庄繁长、沼田佑光等上野诸将出兵北信浓佐久郡，冈部元信统辖朝比奈泰朝、朝比奈信置、长野业盛、池田盛周等相模诸将出兵足柄上郡、陶绫郡等地。小山朝幸、斋藤利三等将率左右武卫军（上州兵整编扩充后更名，一个军号两支部队，仿唐朝十六卫中的左右武卫军，随时保持三分之一的常备兵力在役，其职责除了保卫上杉家本据和武藏一国的安全外，还要担任大量的出征作战任务，是直属于上杉家家督一人管辖的嫡系部队，最可信赖、武器装备最为精良）八千余军势攻入甲斐。
武田信玄得知上杉军出兵多路准备攻打自己后就感到如坐针毡起来。这一年冬春之交，甲斐境内爆发了大规模的自然灾害，‘牛马多死，粮运不济’，武田信玄万般无奈之下只能请担任幕臣的其父武田信虎出面求和。武田信玄还声称将会归还侵占的北信浓、伊豆等地，只是希望能够获得一些时间让转封的家臣和代官撤出。
既然出兵的目的就是要夺回被侵占的领地，眼下武田信玄愿意主动归还，那又何必刀兵相向呢、劳师伤财呢？
随后，谦信倒是被武田信虎说服了，希望朝定暂停对足柄上郡、陶绫郡、伊豆、甲斐、北信浓等地的侵攻，给武田家一些时间将家臣、兵力撤出。
朝定也不是刻意想与谦信唱反调，他认为：武田信玄向来言而无信，‘弱则求盟，强则入寇’，此时求和，必然有诈！
不过，为了给谦信面子，朝定暂停了对足柄上郡、陶绫郡、伊豆、北信浓、甲斐等地的攻势，将大军撤回领内，但是并没有将军势解散，反而在领内大规模的征召军势，进行备战。就连坐镇常陆的太田资正也被朝定命令征召一万余军势进驻镰仓。
正月十日，小田氏治见武田军撤回骏河、伊豆等国后便停止了对常陆各地的袭扰，立即向朝定请罪臣服。而朝定由于眼下即将与武田家展开大战的情况下同意，不过还是令盐屋秋贞、游佐续光、西野宗庆等常陆诸将时刻做好与小田家交战的准备。
与此同时，朝定也获知了织田信长拥立足利义昭顺利上洛，足利义昭迅速获得了将军宣下的消息。朝定立即派遣重臣广泽忠信上洛前去责问织田信长为何将只将近卫前久一人逐出京都，织田家是否有意与上杉家交恶，他对此感到非常不满，希望织田家能给自己一个满意的答复。
织田信长在看到朝定的书信后自知如今的织田家还没有与称霸东国的上杉家为敌的能力和实力，他很清楚一旦织田家真的与上杉家交恶，那么执上杉家牛耳的朝定必然会令占据大部分加贺国的柿崎景家为先阵出兵上洛，到时候越前的朝仓家、若狭的武田家肯定不会与上杉家为敌，反而会助其一臂之力，最后的结局很有可能导致织田家上洛的一切成果都化为乌有，足利义昭必然也会被赶下征夷大将军之位。织田信长在广泽忠信上洛后恭恭敬敬的说明了近卫前久给足利义荣的将军宣下开绿灯一事，并且声称将近卫前久逐出京都一事与自己毫无关系，完全是足利义昭一人所为。
朝定深知近卫前久被罢官逐出京都与自己是脱不开干系的，眼下并不能对他不闻不问。朝定随后派遣家臣前去石山，请近卫前久举族迁往关东，告诉他江户城即将扩建完成，近卫家的府邸也已经建造完成。
近卫前久见自己短时间内无法返回京都后，万般无奈之下只好同意朝定的邀请，带上其父近卫植家等百余人经坂本、越前国走陆路至加贺国，而后在加贺守护柿崎景家派兵护送下抵达越后府中御馆。近卫一族在府中御馆休息三天后经上野国进入武藏。
足利义昭见近卫前久有上杉家这座大山护着之后感到非常愤怒，他不顾织田信长、浅井长政等大名的劝说，立即封小田氏治为常陆守护、下野守护；封南部晴政为陆奥守护、陆中守护、陆前守护；封武田信玄为骏河守护、远江守护、三河守护、飞弹守护、上野守护、伊豆守护、武藏守护，兼任甲斐守护、信浓守护；封伊势氏隆为相模守护、上总守护、安房守护。同时剥夺朝定之前所担任的武藏守护、相模守护、下野守护、上总守护等守护职；剥夺上杉景满之前所担任的上野守护；剥夺柿崎景家之前所担任的加贺守护；剥夺宇佐美定满之前所担任的能登守护；剥夺上杉谦信之前所担任的北陆探题、越后守护、越中守护、侍所所司等役职，仅保留关东管领的役职；剥夺今川氏真的关东公方、骏河守护的役职。
朝定得知自己和柿崎景家、宇佐美定满、上杉景满等人的役职全部被剥夺后的消息对足利义昭感到非常不满，就连对幕府忠心耿耿的谦信都被剥夺了大部分的役职，仅保留关东管领一职。上杉家上上下下都纷纷上书，请求立即发兵上洛，废除足利义昭的征夷大将军一职，拥今川氏真为将军候补。
面对家中上上下下群情激愤，朝定和谦信二人都保持着冷静。因为据细作汇报，武田信玄正在三河、飞弹、信浓、甲斐、远江、骏河、伊豆、东美浓等国大举近乎极限的征召军势，意图将奥信浓全境夺取，进而再趁势侵攻越后、越中、上野、相模等地。
为了不让武田信玄获得先发制人的优势，谦信和朝定立即在越后、越中、能登、北加贺、南出羽、上野、武藏、下总等国大举征召军势，准备在武田信玄发兵之前攻入北信浓，与武田军在川中岛一带展开决战，意图从而一战定胜负，将武田家打得体无完肤，从此再也没有能力入侵他国。
而武田信玄的意图则是一战夺取信浓全境，当名副其实的信浓守护。在尽可能的情况下消灭上杉家的有生力量，好在之后的‘越后侵攻’、‘越中侵攻’、‘上野侵攻’、‘相模侵攻’、‘武藏侵攻’等战事中减少大量的阻力。最后再效仿‘旭日将军’木曾义仲夺取北陆道诸国后出兵一举攻入京都，从而成为天下人。
二月十五日，武田信玄经过了一个月的大规模征召招募浪人、野武士后，便率六万五千余大军倾巢而出，朝着奥信浓饭山城进军。作为武田家旗下的从属大名伊势氏隆本着一荣俱荣一损俱损的态度，在足柄上郡内征召了一千余军势后派出前去支援武田家，而武田信玄也本着多多益善的原则将这支援军笑纳了。织田信长在暗中向武田家送去了大量的粮草辎重，希望武田信玄能够尽可能的削弱上杉家的实力，这样自己就能够毫无顾忌的攻打北陆道的若狭国、越前国等地。
同时，朝定则是率左右武卫军八千军势和各领国征召的三万大军进入越后府中待命。而斋藤道三、山崎秀仙、杰山云胜、秋山定纲等人担任留守役，率军一万余镇守武藏。冈部元信、朝比奈泰朝、朝比奈信置等相模诸将守备相模国各郡严防小田原伊势家和武田家的入侵；笠原定胜、冈本安泰等安房诸将率军五千余进入相模国，驻扎在相模川一带待命；难波田宪次、寒河江光俊、寒河江光俊、斋藤俊氏等陆前诸将率军一万余北上进驻闭伊郡协助浅利则祐，严防南部家的侵攻；相马义胤、田村隆显二人率军七千余进驻陆中国协助上杉长亲（河田长亲）、平重定、木内胤信、松户胤赖等将严防南部家的侵攻；盐屋秋贞、游佐续光、西野宗庆等常陆诸将各自率部在领内待命，做好与小田家交战的准备；宫城政业率军五千余进驻常陆国鹿岛郡，暂时统辖常陆诸将，随时支援常陆国各郡。
另一方面，谦信则是主要征召越后、越中、能登、北加贺、南出羽等地，随后便率四万余大军先行进入奥信浓，将本阵布置在饭山城内。
